Чему вы научитесь
Метагеномика — раздел геномики, изучающий геном не отдельного организма, а совокупности обитателей микробных сообществ, живущих в разных природных условиях. На протяжении 4,5 миллиардов лет микроорганизмы являются доминирующей формой жизни на Земле. При этом только около 2% из них может быть выращено в лабораторных условиях, а об остальных мы не знаем практически ничего. Детальный анализ состава и функционирования сложных сообществ позволяет ответить на многие вопросы, связанные со здоровьем человека, охраной окружающей среды, хранением и переработкой продуктов питания, разработкой альтернативных источников энергии, и т.д. Такой анализ возможен только в результате биоинформатической обработки огромных массивов данных, получаемых при секвенировании суммарной метагеномной ДНК и/или отдельных генов.
В предлагаемом курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика» мы затронем вопросы подготовки метагеномных проб и особенностей их анализа; математических подходов, лежащих в основе созданных специально для этого типа данных программных продуктов; вопросы секвенирования и сборки метагеномов, их аннотации и применения.
С середины курса участникам будет предложен проект, по результатам работы над которым и будет в основном оцениваться степень освоения ими материала курса.В рамках этого проекта учащиеся будут самостоятельно работать с реальными данными, проведут самостоятельный анализ.
О курсе
Для кого этот курс
Начальные требования
Курс предназначен для тех, кто готов учиться, готов осваивать новые,
передовые знания, необходимые уже сегодня всем биологам, медикам,
экологам и многим другим. Навыки программирования не обязательны, но
очень приветствуются. Приглашаются слушатели, начиная с уровня
последнего года бакалавриата и далее. Успешному освоению курса поможет
выпущенный ранее курс «Введение в Биоинформатику», т.к. он знакомит не
только с анализом геномных данных, но и прививает базовые знания
операционной системы LINUX.
Преподаватели курса
41 569
Формат курса
