Курс на Stepik
Обложка курса «Введение в биоинформатику: метагеномика» на Stepik
Бесплатно

Введение в биоинформатику: метагеномика ★ 4.862

Открыть на
STEPIK.ORG

Курс посвящен введению в метагеномику и затрагивает основные теоретические и практические подходы анализа видового состава, генетического материала и функционала сообществ микроорганизмов, обитающих в окружающей среде.

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Учеников на курсе 6 412
Сертификаты, выданные на курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Сертификатов выдано 83
Отзывы о курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Отзывов получено 29
Рейтинг курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Рейтинг курса 4.862
Уроки в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Количество уроков 46
Тесты в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Количество квизов 43
Время прохождения курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Время прохождения курса —
Обновления курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Обновления курса — —
Дата публикации курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Дата публикации курса — ———
Последнее обновление курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Последнее обновление — ———
Сложность easy — ———

Содержание курса

Разделы в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика» 7 разделов Уроки в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика» 46 уроков Тесты в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика» 43 теста Время прохождения курса «Введение в биоинформатику: метагеномика» 5 ч. Последнее обновление курса «Введение в биоинформатику: метагеномика» обн. 2 года назад

1. Введение

7 уроков
Закрытый
1.1 Введение ↗
5 932
5 932
2м 14с
59
Закрытый
1.2 Приветствие ↗
2 943
2 943
0м 30с
28
Закрытый
1.3 Микробы правят миром ↗
3 009
2 469
4м 6с
51
Закрытый
1.4 Биоинформатические приложения ↗
2 796
2 219
8м 11с
54
Закрытый
1.5 Аналитические подходы ↗
2 343
1 929
4м 56с
33
Закрытый
1.6 Метагеномный проект ↗
2 152
1 732
9м 40с
39
Закрытый
1.7 Сборка метагеномов ↗
2 010
1 609
6м 22с
38

2. Экспериментальные данные

8 уроков
Закрытый
2.1 Как получить экспериментальные данные ↗
1 843
1 434
5м 24с
24
Закрытый
2.2 Метагеномные подходы ↗
1 604
1 270
6м 1с
17
Закрытый
2.3 Подходы к секвенированию ↗
1 459
1 159
8м 52с
14
Закрытый
2.4 Аналитические подходы ↗
1 312
1 062
5м 17с
15
Закрытый
2.5 Таргетное секвенирование ↗
1 236
1 015
6м 12с
13
Закрытый
2.6 Сиквенсные платформы ↗
1 157
956
8м 13с
14
Закрытый
2.7 Биоинформатические алгоритмы: геном как строка ↗
1 273
1 273
7м 25с
26
Закрытый
2.8 Тест 1 ↗
1 506
707
11м 33с
-14

3. Аналитические подходы: анализ 16S

5 уроков
Закрытый
3.1 Оценка разнообразия проб ↗
1 107
855
10м 4с
27
Закрытый
3.2 16S рРНК ↗
1 024
838
7м 32с
18
Закрытый
3.3 Базы данных 16S ↗
944
786
6м 21с
14
Закрытый
3.4 Aнализ данных с помощью QIIME ↗
938
672
18м 14с
18
Закрытый
3.5 Тест 2 ↗
905
266
24м 37с
-1

4. Аналитические подходы: биннинг

6 уроков
Закрытый
4.1 Что такое биннинг? ↗
851
624
9м 0с
11
Закрытый
4.2 Программа MyCC ↗
721
544
8м 14с
11
Закрытый
4.3 Алгоритмы биннинга ↗
666
666
10м 1с
16
Закрытый
4.4 Контролируемый и Неконтролируемый Биннинг ↗
618
618
9м 51с
17
Закрытый
4.5 Кластеризация ↗
645
645
7м 27с
9
Закрытый
4.6 Тест 3 ↗
732
455
2м 13с
6

5. Аналитические подходы: Метагеномная сборка

10 уроков
Закрытый
5.1 Сборка данных микробиоты ↗
699
606
10м 9с
14
Закрытый
5.2 Скачивание данных ↗
604
604
7м 33с
10
Закрытый
5.3 Оценка качества данных ↗
595
595
12м 3с
11
Закрытый
5.4 Метагеномная сборка ↗
596
596
6м 7с
5
Закрытый
5.5 Как выглядит сборка ↗
574
574
6м 58с
5
Закрытый
5.6 Отчет QUAST ↗
571
571
6м 0с
3
Закрытый
5.7 Алгоритмы сборки ↗
558
558
6м 31с
8
Закрытый
5.8 Контиги ↗
535
535
7м 37с
8
Закрытый
5.9 Сборка отдельных генов ↗
543
543
4м 24с
8
Закрытый
5.10 Тест 4 ↗
643
359
2м 22с
5

6. Аннотация и анализ метаболических путей

7 уроков
Закрытый
6.1 Аннотация генов ↗
627
533
7м 18с
7
Закрытый
6.2 Программа MetaGeneMark ↗
561
561
6м 17с
5
Закрытый
6.3 Функция гена ↗
525
525
8м 11с
5
Закрытый
6.4 Алгоритмы аннотации ↗
524
524
6м 15с
7
Закрытый
6.5 Функциональный метагеномный анализ ↗
518
425
8м 22с
10
Закрытый
6.6 Сравнительный анализ ↗
509
385
9м 16с
9
Закрытый
6.7 Тест 5 ↗
605
383
3м 11с
8

7. Метагеномный проект

3 урока
Закрытый
7.1 "1000-летний секрет зубного камня" ↗
679
679
1м 58с
5
Закрытый
7.2 Тест-Проект: анализ метагенома ↗
793
234
12м 39с
6
Закрытый
7.3 Заключение ↗
522
522
1м 17с
13