Курс на Stepik
Обложка курса «Введение в биоинформатику: метагеномика» на Stepik
Бесплатно

Введение в биоинформатику: метагеномика 4.871

Открыть на
STEPIK.ORG

Курс посвящен введению в метагеномику и затрагивает основные теоретические и практические подходы анализа видового состава, генетического материала и функционала сообществ микроорганизмов, обитающих в окружающей среде.

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Учеников на курсе 6 524
Сертификаты, выданные на курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Сертификатов выдано 83
Отзывы о курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Отзывов получено 31
Рейтинг курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Рейтинг курса 4.871
Уроки в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Количество уроков 46
Тесты в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Количество квизов 43
Время прохождения курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Время прохождения курса
Обновления курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Обновления курса
Дата публикации курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Дата публикации курса
Последнее обновление курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Последнее обновление
Сложность easy

Содержание курса

Разделы в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика» 7 разделов Уроки в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика» 46 уроков Тесты в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика» 43 теста Время прохождения курса «Введение в биоинформатику: метагеномика» 5 ч. Последнее обновление курса «Введение в биоинформатику: метагеномика» обн. 2 года назад

Введение

7 уроков
1. Введение
2. Приветствие
3. Микробы правят миром
4. Биоинформатические приложения
5. Аналитические подходы
6. Метагеномный проект
7. Сборка метагеномов

Экспериментальные данные

8 уроков
1. Как получить экспериментальные данные
2. Метагеномные подходы
3. Подходы к секвенированию
4. Аналитические подходы
5. Таргетное секвенирование
6. Сиквенсные платформы
7. Биоинформатические алгоритмы: геном как строка
8. Тест 1

Аналитические подходы: анализ 16S

5 уроков
1. Оценка разнообразия проб
2. 16S рРНК
3. Базы данных 16S
4. Aнализ данных с помощью QIIME
5. Тест 2

Аналитические подходы: биннинг

6 уроков
1. Что такое биннинг?
2. Программа MyCC
3. Алгоритмы биннинга
4. Контролируемый и Неконтролируемый Биннинг
5. Кластеризация
6. Тест 3

Аналитические подходы: Метагеномная сборка

10 уроков
1. Сборка данных микробиоты
2. Скачивание данных
3. Оценка качества данных
4. Метагеномная сборка
5. Как выглядит сборка
6. Отчет QUAST
7. Алгоритмы сборки
8. Контиги
9. Сборка отдельных генов
10. Тест 4

Аннотация и анализ метаболических путей

7 уроков
1. Аннотация генов
2. Программа MetaGeneMark
3. Функция гена
4. Алгоритмы аннотации
5. Функциональный метагеномный анализ
6. Сравнительный анализ
7. Тест 5

Метагеномный проект

3 урока
1. "1000-летний секрет зубного камня"
2. Тест-Проект: анализ метагенома
3. Заключение