Курс на Stepik
Обложка курса «Введение в биоинформатику: метагеномика» на Stepik
Бесплатно

Введение в биоинформатику: метагеномика ★ 4.871

Открыть на
STEPIK.ORG

Курс посвящен введению в метагеномику и затрагивает основные теоретические и практические подходы анализа видового состава, генетического материала и функционала сообществ микроорганизмов, обитающих в окружающей среде.

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Учеников на курсе 6 596
Сертификаты, выданные на курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Сертификатов выдано 83
Отзывы о курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Отзывов получено 31
Рейтинг курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Рейтинг курса 4.871
Уроки в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Количество уроков 46
Тесты в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика»Количество квизов 43
Время прохождения курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Время прохождения курса —
Обновления курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Обновления курса — —
Дата публикации курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Дата публикации курса — ———
Последнее обновление курса «Введение в биоинформатику: метагеномика»Последнее обновление — ———
Сложность easy — ———

Содержание курса

Разделы в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика» 7 разделов Уроки в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика» 46 уроков Тесты в курсе «Введение в биоинформатику: метагеномика» 43 теста Время прохождения курса «Введение в биоинформатику: метагеномика» 6 ч. Последнее обновление курса «Введение в биоинформатику: метагеномика» обн. 2 года назад

Введение

7 уроков
1. Введение ↗
2. Приветствие ↗
3. Микробы правят миром ↗
4. Биоинформатические приложения ↗
5. Аналитические подходы ↗
6. Метагеномный проект ↗
7. Сборка метагеномов ↗

Экспериментальные данные

8 уроков
1. Как получить экспериментальные данные ↗
2. Метагеномные подходы ↗
3. Подходы к секвенированию ↗
4. Аналитические подходы ↗
5. Таргетное секвенирование ↗
6. Сиквенсные платформы ↗
7. Биоинформатические алгоритмы: геном как строка ↗
8. Тест 1 ↗

Аналитические подходы: анализ 16S

5 уроков
1. Оценка разнообразия проб ↗
2. 16S рРНК ↗
3. Базы данных 16S ↗
4. Aнализ данных с помощью QIIME ↗
5. Тест 2 ↗

Аналитические подходы: биннинг

6 уроков
1. Что такое биннинг? ↗
2. Программа MyCC ↗
3. Алгоритмы биннинга ↗
4. Контролируемый и Неконтролируемый Биннинг ↗
5. Кластеризация ↗
6. Тест 3 ↗

Аналитические подходы: Метагеномная сборка

10 уроков
1. Сборка данных микробиоты ↗
2. Скачивание данных ↗
3. Оценка качества данных ↗
4. Метагеномная сборка ↗
5. Как выглядит сборка ↗
6. Отчет QUAST ↗
7. Алгоритмы сборки ↗
8. Контиги ↗
9. Сборка отдельных генов ↗
10. Тест 4 ↗

Аннотация и анализ метаболических путей

7 уроков
1. Аннотация генов ↗
2. Программа MetaGeneMark ↗
3. Функция гена ↗
4. Алгоритмы аннотации ↗
5. Функциональный метагеномный анализ ↗
6. Сравнительный анализ ↗
7. Тест 5 ↗

Метагеномный проект

3 урока
1. "1000-летний секрет зубного камня" ↗
2. Тест-Проект: анализ метагенома ↗
3. Заключение ↗