Курс на Stepik
Курс Bioinformatics Algorithms
Бесплатно

Bioinformatics Algorithms 0.000

Открыть на
STEPIK.ORG

https://class.coursera.org/bioinformatics-002

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Bioinformatics Algorithms»Учеников на курсе 13 018
Сертификаты, выданные на курсе «Bioinformatics Algorithms»Сертификатов выдано 0
Отзывы о курсе «Bioinformatics Algorithms»Отзывов получено 0
Рейтинг курса «Bioinformatics Algorithms»Рейтинг курса 0.000
Уроки в курсе «Bioinformatics Algorithms»Количество уроков 118
Тесты в курсе «Bioinformatics Algorithms»Количество квизов 43
Задачи с кодом в курсе «Bioinformatics Algorithms»Количество задач с кодом 79
Время прохождения курса «Bioinformatics Algorithms»Время прохождения курса
Обновления курса «Bioinformatics Algorithms»Обновления курса
Дата публикации курса «Bioinformatics Algorithms»Дата публикации курса
Последнее обновление курса «Bioinformatics Algorithms»Последнее обновление

Содержание курса

Разделы в курсе «Bioinformatics Algorithms» 6 разделов Уроки в курсе «Bioinformatics Algorithms» 118 уроков Тесты в курсе «Bioinformatics Algorithms» 43 теста Задачи в курсе «Bioinformatics Algorithms» 79 задач Время прохождения курса «Bioinformatics Algorithms» 84 ч. Последнее обновление курса «Bioinformatics Algorithms» обн. 1 год назад

1. Where in the Genome Does DNA Replication Begin?

23 урока
Закрытый
1.1 A Journey of a Thousand Miles. . .
88 333
0
6м 14с
1707
Открытый
1.2 Hidden Messages in the Replication Origin
64 532
6 615
71м 33с
725
Закрытый
1.3 Some Hidden Messages are More Surprising than Others
35 545
13 219
40м 25с
200
Закрытый
1.4 An Explosion of Hidden Messages
29 761
7 569
83м 26с
134
Закрытый
1.5 The Simplest Way to Replicate DNA
24 640
20 310
5м 39с
185
Закрытый
1.6 Asymmetry of Replication
21 304
19 021
4м 51с
107
Закрытый
1.7 Peculiar Statistics of the Forward and Reverse Half-Strands
20 444
3 951
49м 34с
60
Закрытый
1.8 Some Hidden Messages are More Elusive than Others
19 208
3 144
164м 18с
39
Закрытый
1.9 A Final Attempt at Finding DnaA Boxes in E. coli
15 987
13 334
3м 19с
49
Закрытый
1.10 Epilogue: Complications in ori Predictions
14 705
3 443
15м 17с
48
Закрытый
1.11 CS: The Frequency Array
19 958
5 809
80м 16с
39
Закрытый
1.12 CS: Converting Patterns to Numbers and Vice-Versa
14 917
5 146
24м 52с
49
Закрытый
1.13 CS: Finding Frequent Words by Sorting
13 484
10 909
2м 37с
37
Закрытый
1.14 CS: Solving the Clump Finding Problem
14 859
10 921
2м 26с
43
Закрытый
1.15 CS: Solving the Frequent Words with Mismatches Problem
10 150
4 604
3м 39с
27
Закрытый
1.16 CS: Generating the Neighborhood of a String
13 130
5 735
27м 29с
11
Закрытый
1.17 CS: Finding Frequent Words with Mismatches by Sorting
8 290
8 290
1м 4с
4
Закрытый
1.18 Detour: Big-O Notation
16 656
16 656
1м 27с
53
Закрытый
1.19 Detour: Probabilities of Patterns in a String
4 270
1 001
41м 24с
2
Закрытый
1.20 Detour: The Most Beautiful Experiment in Biology
25 324
19 925
4м 39с
231
Закрытый
1.21 Detour: Directionality of DNA Strands
25 017
25 017
1м 47с
154
Закрытый
1.22 Detour: The Towers of Hanoi
4 364
1 833
2м 37с
15
Закрытый
1.23 Detour: The Overlapping Words Paradox
3 763
500
2м 3с
2

2. Which DNA Patterns Play the Role of Molecular Clocks?

17 уроков
Закрытый
2.1 Do We Have a "Clock" Gene?
13 340
12 172
4м 16с
101
Закрытый
2.2 Motif Finding Is More Difficult Than You Think
12 320
6 492
86м 36с
62
Закрытый
2.3 Scoring Motifs
11 180
4 701
36м 16с
76
Закрытый
2.4 From Motif Finding to Finding a Median String
10 549
5 458
54м 30с
57
Закрытый
2.5 Greedy Motif Search
10 149
5 659
145м 13с
-94
Закрытый
2.6 Motif Finding Meets Oliver Cromwell
9 411
5 499
16м 12с
55
Закрытый
2.7 Randomized Motif Search
9 823
4 727
82м 36с
-33
Закрытый
2.8 How Can a Randomized Algorithm Perform So Well?
8 201
2 894
22м 42с
22
Закрытый
2.9 Gibbs Sampling
8 451
4 401
81м 56с
-33
Закрытый
2.10 Gibbs Sampling in Action
7 554
6 589
3м 21с
26
Закрытый
2.11 Epilogue: How Does Tuberculosis Hibernate?
6 860
2 079
4м 53с
33
Закрытый
2.12 CS: Solving the Median String Problem
8 061
3 481
28м 38с
15
Закрытый
2.13 Detour: Gene Expression
1 882
1 882
1м 39с
0
Закрытый
2.14 Detour: DNA Arrays
1 879
1 879
1м 52с
0
Закрытый
2.15 Detour: Buffon's Needle
1 520
766
4м 36с
0
Закрытый
2.16 Detour: Complications in Motif Finding
1 417
1 250
1м 24с
0
Закрытый
2.17 Detour: Relative entropy
765
663
1м 52с
-2

3. How Do We Assemble Genomes?

20 уроков
Закрытый
3.1 Exploding Newspapers
11 528
8 387
4м 59с
167
Закрытый
3.2 The String Reconstruction Problem
9 906
4 487
28м 22с
81
Закрытый
3.3 String Reconstruction as a Walk in the Overlap Graph
8 156
2 657
84м 47с
51
Закрытый
3.4 Another Graph for String Reconstruction
7 284
4 662
61м 56с
40
Закрытый
3.5 Walking in the de Bruijn Graph
6 891
3 388
27м 7с
42
Закрытый
3.6 The Seven Bridges of Königsberg
6 344
3 250
4м 5с
39
Закрытый
3.7 Euler's Theorem
6 698
5 845
8м 45с
39
Закрытый
3.8 From Euler's Theorem to an Algorithm for Finding Eulerian Cycles
6 375
2 590
304м 5с
38
Закрытый
3.9 Assembling Genomes from Read-Pairs
5 646
1 575
139м 25с
17
Закрытый
3.10 Epilogue: Genome Assembly Faces Real Sequencing Data
4 707
1 000
113м 50с
28
Закрытый
3.11 CS: The Effect of Gluing on the Adjacency Matrix
5 384
5 384
0м 7с
18
Закрытый
3.12 CS: Reconstructing a String from the Paired de Bruijn Graph
3 700
1 588
45м 53с
20
Закрытый
3.13 CS: Maximal Non-Branching Paths in a Graph
4 279
1 187
99м 3с
13
Закрытый
3.14 Detour: A Short History of DNA Sequencing Technologies
1 368
1 188
5м 43с
0
Закрытый
3.15 Detour: Repeats in the Human Genome
1 095
1 095
1м 29с
0
Закрытый
3.16 Detour: An Introduction to Graphs
5 658
2 209
7м 55с
27
Закрытый
3.17 Detour: Hamilton's Icosian Game
1 038
944
1м 18с
0
Закрытый
3.18 Detour: Tractable and Intractable Problems
5 030
2 808
2м 17с
32
Закрытый
3.19 Detour: From Euler to Hamilton to de Bruijn
1 032
974
2м 37с
0
Закрытый
3.20 Detour: The Seven Bridges of Kaliningrad
1 008
1 008
1м 50с
0

4. How Do We Sequence Antibiotics?

19 уроков
Закрытый
4.1 The Discovery of Antibiotics
7 313
6 982
3м 11с
38
Закрытый
4.2 How Do Bacteria Make Antibiotics?
7 524
2 999
139м 33с
26
Закрытый
4.3 Dodging the Central Dogma of Molecular Biology
6 396
2 286
2м 12с
28
Закрытый
4.4 Sequencing Antibiotics by Shattering Them into Pieces
6 763
4 246
76м 56с
22
Закрытый
4.5 A Brute Force Algorithm for Cyclopeptide Sequencing
6 247
1 165
72м 32с
11
Закрытый
4.6 A Branch-and-Bound Algorithm for Cyclopeptide Sequencing
6 261
2 140
142м 9с
33
Закрытый
4.7 Mass Spectrometry Meets Golf
5 991
975
207м 54с
-17
Закрытый
4.8 From 20 to More than 100 Amino Acids
4 617
686
39м 18с
5
Закрытый
4.9 The Spectral Convolution Saves the Day
5 208
774
109м 39с
21
Закрытый
4.10 Epilogue: From Simulated to Real Spectra
3 753
122
13м 4с
14
Закрытый
4.11 CS: Generating the Theoretical Spectrum of a Peptide
3 891
1 906
40м 44с
21
Закрытый
4.12 CS: How Fast is CyclopeptideSequencing?
5 068
4 502
1м 15с
5
Закрытый
4.13 CS: Trimming the Peptide Leaderboard
3 285
1 397
48м 34с
9
Закрытый
4.14 Detour: Gause and Lysenkoism
1 732
1 553
2м 0с
0
Закрытый
4.15 Detour: The Discovery of Codons
1 694
1 694
1м 4с
0
Закрытый
4.16 Detour: Quorum Sensing
1 735
1 735
1м 12с
0
Закрытый
4.17 Detour: Molecular Mass
1 597
1 597
1м 49с
0
Закрытый
4.18 Detour: Selenocysteine and Pyrrolysine
1 274
1 274
0м 29с
0
Закрытый
4.19 Detour: Pseudo-polynomial Algorithm for the Turnpike Problem
1 178
49
79м 58с
0

5. How Do We Compare Biological Sequences?

21 урок
Закрытый
5.1 Cracking the Non-Ribosomal Code
6 426
2 924
7м 10с
76
Закрытый
5.2 Introduction to Sequence Alignment
5 130
2 332
7м 58с
32
Закрытый
5.3 The Manhattan Tourist Problem
4 741
1 883
17м 20с
23
Закрытый
5.4 Sequence Alignment is the Manhattan Tourist Problem in Disguise
4 461
2 306
10м 37с
23
Закрытый
5.5 An Introduction to Dynamic Programming: The Change Problem
4 612
1 976
40м 26с
20
Закрытый
5.6 The Manhattan Tourist Problem Revisited
4 314
1 613
79м 35с
16
Закрытый
5.7 From Manhattan to an Arbitrary DAG
4 037
1 020
20м 10с
23
Закрытый
5.8 Backtracking in the Alignment Graph
4 142
2 219
189м 32с
12
Закрытый
5.9 Scoring Alignments
3 969
3 508
3м 9с
16
Закрытый
5.10 From Global to Local Alignment
3 831
1 532
157м 50с
14
Закрытый
5.11 The Changing Faces of Sequence Alignment
3 641
2 015
125м 46с
8
Закрытый
5.12 Penalizing Insertions and Deletions in Sequence Alignment
3 498
1 295
102м 12с
-9
Закрытый
5.13 Space-Efficient Sequence Alignment
3 219
781
148м 6с
-17
Закрытый
5.14 Epilogue: Multiple Sequence Alignment
2 986
504
68м 43с
1
Закрытый
5.15 Detour: Fireflies and the Non-Ribosomal Code
1 191
1 003
2м 27с
0
Закрытый
5.16 Detour: The Towers of Hanoi
4 364
1 833
2м 37с
15
Закрытый
5.17 Detour: Finding an LCS without Building a City
614
614
1м 53с
0
Закрытый
5.18 Detour: Constructing a Topological Ordering
1 175
61
69м 54с
0
Закрытый
5.19 Detour: PAM Scoring Matrices
960
31
1м 16с
-1
Закрытый
5.20 Detour: Divide-and-Conquer Algorithms
891
770
2м 39с
0
Закрытый
5.21 Detour: Scoring Multiple Alignments
938
54
1м 32с
0

6. Are There Fragile Regions in the Human Genome?

18 уроков
Закрытый
6.1 Of Mice and Men
2 538
1 174
9м 55с
28
Закрытый
6.2 The Random Breakage Model of Chromosome Evolution
2 236
829
4м 52с
6
Закрытый
6.3 Sorting by Reversals
2 224
1 039
13м 50с
11
Закрытый
6.4 A Greedy Algorithm for Sorting by Reversals
2 966
683
76м 13с
-7
Закрытый
6.5 Breakpoints
2 875
528
39м 2с
4
Закрытый
6.6 Rearrangements in Tumor Genomes
2 099
1 921
2м 4с
11
Закрытый
6.7 From Unichromosomal to Multichromosomal Genomes
2 066
1 864
6м 22с
13
Закрытый
6.8 Breakpoint Graphs
2 408
1 171
7м 45с
7
Закрытый
6.9 Computing the 2-Break Distance
2 859
775
221м 38с
9
Закрытый
6.10 Rearrangement Hotspots in the Human Genome
1 952
961
3м 26с
17
Закрытый
6.11 Epilogue: Synteny Block Construction
2 609
202
113м 57с
3
Закрытый
6.12 CS: From Genomes to the Breakpoint Graph
2 025
815
187м 55с
4
Закрытый
6.13 CS: Solving the 2-Break Sorting Problem
1 933
609
169м 53с
-11
Закрытый
6.14 Detour: Why is the Gene Content of X Chromosomes So Conserved?
551
551
1м 50с
0
Закрытый
6.15 Detour: Discovery of Genome Rearrangements
493
493
1м 52с
0
Закрытый
6.16 Detour: The Exponential Distribution
443
390
2м 36с
0
Закрытый
6.17 Detour: Bill Gates and David X. Cohen Flip Pancakes
497
464
2м 16с
0
Закрытый
6.18 Detour: Sorting Linear Permutations by Reversals
346
287
2м 48с
0