Содержание курса
1. How Do We Locate Disease-Causing Mutations? (Week 1/3)
11 уроков
27 144
14 315
531м
79
Закрытый
1.1
What Causes Ohdo Syndrome?
↗
5 026
3 587
3м 3с
34
Закрытый
1.2
Introduction to Multiple Pattern Matching
↗
3 537
1 297
2м 51с
11
Закрытый
1.3
Herding Patterns into a Trie
↗
3 348
1 428
113м 19с
9
Закрытый
1.4
Preprocessing the Genome Instead
↗
2 429
1 641
4м 46с
4
Закрытый
1.5
Suffix Trees
↗
2 474
758
236м 9с
4
Закрытый
1.6
CS: Constructing a Suffix Tree
↗
1 669
1 401
2м 33с
0
Закрытый
1.7
CS: Maximal Non-Branching Paths in a Graph
↗
4 279
1 187
99м 3с
13
Закрытый
1.8
CS: Solving the Longest Shared Substring Problem
↗
1 445
151
68м 30с
4
Закрытый
1.9
Detour: The Reference Human Genome
↗
1 057
1 057
1м 17с
0
Закрытый
1.10
Detour: Rearrangements, Insertions, & Deletions in Human Genomes
↗
955
955
1м 48с
0
Закрытый
1.11
Detour: The Aho-Corasick Algorithm
↗
925
853
2м 37с
0
2. How Do We Locate Disease-Causing Mutations? (Week 2/3)
6 уроков
10 620
5 250
195м
39
Закрытый
2.1
Suffix Arrays
↗
2 249
1 229
27м 8с
7
Закрытый
2.2
The Burrows-Wheeler Transform
↗
2 034
365
22м 53с
5
Закрытый
2.3
A First Attempt at Inverting the Burrows-Wheeler Transform
↗
1 816
1 655
3м 35с
7
Закрытый
2.4
The First-Last Property and Burrows-Wheeler Inversion
↗
1 889
802
62м 54с
13
Закрытый
2.5
Pattern Matching with the Burrows-Wheeler Transform
↗
1 853
1 154
63м 18с
7
Закрытый
2.6
Detour: Suffix Arrays and Suffix Trees
↗
779
45
18м 14с
0
3. How Do We Locate Disease-Causing Mutations? (Week 3/3)
5 уроков
8 166
4 260
175м
20
Закрытый
3.1
Speeding Up Burrows-Wheeler Pattern Matching
↗
1 977
1 102
25м 25с
3
Закрытый
3.2
Where are the Matched Patterns?
↗
1 749
1 640
2м 2с
4
Закрытый
3.3
Burrows and Wheeler Set Up Checkpoints
↗
1 727
1 011
52м 4с
7
Закрытый
3.4
Epilogue: Mismatch-Tolerant Read Mapping
↗
1 645
241
77м 5с
4
Закрытый
3.5
CS: Partial Suffix Array Construction
↗
1 068
266
19м 33с
2
4. Which Animal Gave Us SARS? (Week 1/3)
9 уроков
17 332
9 025
276м
149
Закрытый
4.1
The Fastest Outbreak
↗
3 311
2 780
4м 4с
53
Закрытый
4.2
Transforming Distance Matrices into Evolutionary Trees
↗
2 857
1 019
106м 38с
41
Закрытый
4.3
Toward An Algorithm for Distance-Based Phylogeny Construction
↗
2 203
1 010
39м 33с
26
Закрытый
4.4
Additive Phylogeny
↗
1 974
755
115м 41с
2
Закрытый
4.5
Detour: When Did HIV Jump from Primates to Humans?
↗
376
376
1м 9с
0
Закрытый
4.6
Detour: An Introduction to Graphs
↗
5 658
2 209
7м 55с
27
Закрытый
4.7
Detour: Searching for a Tree Fitting a Distance Matrix
↗
338
306
2м 38с
0
Закрытый
4.8
Detour: The Four Point Condition
↗
313
289
2м 39с
0
Закрытый
4.9
Detour: Did Bats Give Us SARS?
↗
302
281
2м 46с
0
5. Which Animal Gave Us SARS? (Week 2/3)
5 уроков
5 501
2 339
228м
22
Закрытый
5.1
Using Least Squares to Construct Approximate Phylogenies
↗
1 804
277
10м 30с
3
Закрытый
5.2
Ultrametric Evolutionary Trees
↗
1 589
785
122м 48с
11
Закрытый
5.3
The Neighbor-Joining Algorithm
↗
1 489
749
94м 50с
8
Закрытый
5.4
Detour: Why Does the Neighbor-Joining Algorithm Work?
↗
342
270
2м 46с
0
Закрытый
5.5
Detour: Computing Limb Lengths in the Neighbor-Joining Algorithm
↗
277
258
1м 16с
0
6. Which Animal Gave Us SARS? (Week 3/3)
6 уроков
5 868
3 089
395м
-1
Закрытый
6.1
Character-Based Tree Reconstruction
↗
1 520
1 282
6м 41с
10
Закрытый
6.2
The Small Parsimony Problem
↗
1 420
617
214м 14с
-6
Закрытый
6.3
The Large Parsimony Problem
↗
1 324
401
169м 26с
-11
Закрытый
6.4
Epilogue: Evolutionary Trees Fight Crime
↗
1 082
289
3м 40с
6
Закрытый
6.5
Detour: Giant Panda: Bear or Raccoon?
↗
262
262
1м 58с
0
Закрытый
6.6
Detour: Where Did Humans Come From?
↗
260
238
2м 16с
0
7. How Did Yeast Become a Wine-Maker? (Week 1/2)
12 уроков
17 435
11 622
187м
89
Закрытый
7.1
An Evolutionary History of Wine-Making
↗
2 919
2 270
3м 48с
35
Закрытый
7.2
Identifying Genes Responsible for the Diauxic Shift
↗
2 341
2 031
5м 40с
17
Закрытый
7.3
Introduction to Clustering
↗
2 223
1 927
4м 24с
14
Закрытый
7.4
The Good Clustering Principle
↗
1 411
1 228
2м 52с
4
Закрытый
7.5
Clustering as an Optimization Problem
↗
1 353
523
9м 48с
5
Закрытый
7.6
Farthest First Traversal
↗
1 262
414
62м 48с
7
Закрытый
7.7
k-Means Clustering
↗
1 810
788
27м 34с
5
Закрытый
7.8
The Lloyd Algorithm
↗
1 685
219
71м 49с
0
Закрытый
7.9
Clustering Genes Implicated in the Diauxic Shift
↗
1 525
1 316
1м 0с
2
Закрытый
7.10
Detour: Measuring Gene Expression
↗
319
319
1м 26с
0
Закрытый
7.11
Detour: Microarrays
↗
297
297
1м 16с
0
Закрытый
7.12
Detour: Proof of the Center of Gravity Theorem
↗
290
290
1м 20с
0
8. How Did Yeast Become a Wine-Maker? (Week 2/2)
8 уроков
8 595
4 811
81м
28
Закрытый
8.1
Limitations of k-means Clustering
↗
1 563
1 325
2м 36с
3
Закрытый
8.2
From Coin Flipping to k-Means Clustering
↗
1 290
713
7м 8с
7
Закрытый
8.3
Making Soft Decisions in Coin Flipping
↗
1 335
747
3м 53с
3
Закрытый
8.4
Soft k-Means Clustering
↗
1 362
780
3м 17с
2
Закрытый
8.5
Hierarchical Clustering
↗
1 357
657
63м 35с
7
Закрытый
8.6
Epilogue: Clustering Tumor Samples
↗
1 113
304
2м 46с
6
Закрытый
8.7
Detour: Gene Expression Matrix to a Distance/Similarity Matrix
↗
292
257
1м 48с
0
Закрытый
8.8
Detour: Clustering and Corrupted Cliques
↗
283
28
1м 7с
0
9. Why Have Biologists Still Not Developed an HIV Vaccine? (Wk 1/2)
1 урок
729
429
186м
5
Закрытый
9.1
Hidden Markov Models Code Challenges (Week 1)
↗
729
429
186м 21с
5
10. Why Have Biologists Still Not Developed an HIV Vaccine? (Wk 2/2)
1 урок
612
81
677м
1
Закрытый
10.1
Hidden Markov Models Code Challenges (Week 2)
↗
612
81
677м 12с
1
11. Was T. rex Just a Big Chicken? (Week 1/2)
1 урок
888
480
295м
2
Закрытый
11.1
Proteomics Code Challenges Week 1
↗
888
480
295м 53с
2
12. Was T. rex Just a Big Chicken? (Week 2/2)
1 урок
797
300
269м
-1
Закрытый
12.1
Proteomics Code Challenges Week 2
↗
797
300
269м 5с
-1