Курс на Stepik
Курс Bioinformatics Algorithms (Part 2)
Бесплатно

Bioinformatics Algorithms (Part 2) 0.000

Открыть на
STEPIK.ORG

Interactive Textbook accompanying https://www.coursera.org/course/bioinformatics2.

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Учеников на курсе 3 429
Сертификаты, выданные на курсе «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Сертификатов выдано 0
Отзывы о курсе «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Отзывов получено 0
Рейтинг курса «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Рейтинг курса 0.000
Уроки в курсе «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Количество уроков 66
Тесты в курсе «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Количество квизов 5
Задачи с кодом в курсе «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Количество задач с кодом 51
Время прохождения курса «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Время прохождения курса
Обновления курса «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Обновления курса
Дата публикации курса «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Дата публикации курса
Последнее обновление курса «Bioinformatics Algorithms (Part 2)»Последнее обновление

Содержание курса

Разделы в курсе «Bioinformatics Algorithms (Part 2)» 12 разделов Уроки в курсе «Bioinformatics Algorithms (Part 2)» 66 уроков Тесты в курсе «Bioinformatics Algorithms (Part 2)» 5 тестов Задачи в курсе «Bioinformatics Algorithms (Part 2)» 51 задача Время прохождения курса «Bioinformatics Algorithms (Part 2)» 62 ч. Последнее обновление курса «Bioinformatics Algorithms (Part 2)» обн. 4 года назад

1. How Do We Locate Disease-Causing Mutations? (Week 1/3)

11 уроков
Закрытый
1.1 What Causes Ohdo Syndrome?
5 026
3 587
3м 3с
34
Закрытый
1.2 Introduction to Multiple Pattern Matching
3 537
1 297
2м 51с
11
Закрытый
1.3 Herding Patterns into a Trie
3 348
1 428
113м 19с
9
Закрытый
1.4 Preprocessing the Genome Instead
2 429
1 641
4м 46с
4
Закрытый
1.5 Suffix Trees
2 474
758
236м 9с
4
Закрытый
1.6 CS: Constructing a Suffix Tree
1 669
1 401
2м 33с
0
Закрытый
1.7 CS: Maximal Non-Branching Paths in a Graph
4 279
1 187
99м 3с
13
Закрытый
1.8 CS: Solving the Longest Shared Substring Problem
1 445
151
68м 30с
4
Закрытый
1.9 Detour: The Reference Human Genome
1 057
1 057
1м 17с
0
Закрытый
1.10 Detour: Rearrangements, Insertions, & Deletions in Human Genomes
955
955
1м 48с
0
Закрытый
1.11 Detour: The Aho-Corasick Algorithm
925
853
2м 37с
0

2. How Do We Locate Disease-Causing Mutations? (Week 2/3)

6 уроков
Закрытый
2.1 Suffix Arrays
2 249
1 229
27м 8с
7
Закрытый
2.2 The Burrows-Wheeler Transform
2 034
365
22м 53с
5
Закрытый
2.3 A First Attempt at Inverting the Burrows-Wheeler Transform
1 816
1 655
3м 35с
7
Закрытый
2.4 The First-Last Property and Burrows-Wheeler Inversion
1 889
802
62м 54с
13
Закрытый
2.5 Pattern Matching with the Burrows-Wheeler Transform
1 853
1 154
63м 18с
7
Закрытый
2.6 Detour: Suffix Arrays and Suffix Trees
779
45
18м 14с
0

3. How Do We Locate Disease-Causing Mutations? (Week 3/3)

5 уроков
Закрытый
3.1 Speeding Up Burrows-Wheeler Pattern Matching
1 977
1 102
25м 25с
3
Закрытый
3.2 Where are the Matched Patterns?
1 749
1 640
2м 2с
4
Закрытый
3.3 Burrows and Wheeler Set Up Checkpoints
1 727
1 011
52м 4с
7
Закрытый
3.4 Epilogue: Mismatch-Tolerant Read Mapping
1 645
241
77м 5с
4
Закрытый
3.5 CS: Partial Suffix Array Construction
1 068
266
19м 33с
2

4. Which Animal Gave Us SARS? (Week 1/3)

9 уроков
Закрытый
4.1 The Fastest Outbreak
3 311
2 780
4м 4с
53
Закрытый
4.2 Transforming Distance Matrices into Evolutionary Trees
2 857
1 019
106м 38с
41
Закрытый
4.3 Toward An Algorithm for Distance-Based Phylogeny Construction
2 203
1 010
39м 33с
26
Закрытый
4.4 Additive Phylogeny
1 974
755
115м 41с
2
Закрытый
4.5 Detour: When Did HIV Jump from Primates to Humans?
376
376
1м 9с
0
Закрытый
4.6 Detour: An Introduction to Graphs
5 658
2 209
7м 55с
27
Закрытый
4.7 Detour: Searching for a Tree Fitting a Distance Matrix
338
306
2м 38с
0
Закрытый
4.8 Detour: The Four Point Condition
313
289
2м 39с
0
Закрытый
4.9 Detour: Did Bats Give Us SARS?
302
281
2м 46с
0

5. Which Animal Gave Us SARS? (Week 2/3)

5 уроков
Закрытый
5.1 Using Least Squares to Construct Approximate Phylogenies
1 804
277
10м 30с
3
Закрытый
5.2 Ultrametric Evolutionary Trees
1 589
785
122м 48с
11
Закрытый
5.3 The Neighbor-Joining Algorithm
1 489
749
94м 50с
8
Закрытый
5.4 Detour: Why Does the Neighbor-Joining Algorithm Work?
342
270
2м 46с
0
Закрытый
5.5 Detour: Computing Limb Lengths in the Neighbor-Joining Algorithm
277
258
1м 16с
0

6. Which Animal Gave Us SARS? (Week 3/3)

6 уроков
Закрытый
6.1 Character-Based Tree Reconstruction
1 520
1 282
6м 41с
10
Закрытый
6.2 The Small Parsimony Problem
1 420
617
214м 14с
-6
Закрытый
6.3 The Large Parsimony Problem
1 324
401
169м 26с
-11
Закрытый
6.4 Epilogue: Evolutionary Trees Fight Crime
1 082
289
3м 40с
6
Закрытый
6.5 Detour: Giant Panda: Bear or Raccoon?
262
262
1м 58с
0
Закрытый
6.6 Detour: Where Did Humans Come From?
260
238
2м 16с
0

7. How Did Yeast Become a Wine-Maker? (Week 1/2)

12 уроков
Закрытый
7.1 An Evolutionary History of Wine-Making
2 919
2 270
3м 48с
35
Закрытый
7.2 Identifying Genes Responsible for the Diauxic Shift
2 341
2 031
5м 40с
17
Закрытый
7.3 Introduction to Clustering
2 223
1 927
4м 24с
14
Закрытый
7.4 The Good Clustering Principle
1 411
1 228
2м 52с
4
Закрытый
7.5 Clustering as an Optimization Problem
1 353
523
9м 48с
5
Закрытый
7.6 Farthest First Traversal
1 262
414
62м 48с
7
Закрытый
7.7 k-Means Clustering
1 810
788
27м 34с
5
Закрытый
7.8 The Lloyd Algorithm
1 685
219
71м 49с
0
Закрытый
7.9 Clustering Genes Implicated in the Diauxic Shift
1 525
1 316
1м 0с
2
Закрытый
7.10 Detour: Measuring Gene Expression
319
319
1м 26с
0
Закрытый
7.11 Detour: Microarrays
297
297
1м 16с
0
Закрытый
7.12 Detour: Proof of the Center of Gravity Theorem
290
290
1м 20с
0

8. How Did Yeast Become a Wine-Maker? (Week 2/2)

8 уроков
Закрытый
8.1 Limitations of k-means Clustering
1 563
1 325
2м 36с
3
Закрытый
8.2 From Coin Flipping to k-Means Clustering
1 290
713
7м 8с
7
Закрытый
8.3 Making Soft Decisions in Coin Flipping
1 335
747
3м 53с
3
Закрытый
8.4 Soft k-Means Clustering
1 362
780
3м 17с
2
Закрытый
8.5 Hierarchical Clustering
1 357
657
63м 35с
7
Закрытый
8.6 Epilogue: Clustering Tumor Samples
1 113
304
2м 46с
6
Закрытый
8.7 Detour: Gene Expression Matrix to a Distance/Similarity Matrix
292
257
1м 48с
0
Закрытый
8.8 Detour: Clustering and Corrupted Cliques
283
28
1м 7с
0

9. Why Have Biologists Still Not Developed an HIV Vaccine? (Wk 1/2)

1 урок
Закрытый
9.1 Hidden Markov Models Code Challenges (Week 1)
729
429
186м 21с
5

10. Why Have Biologists Still Not Developed an HIV Vaccine? (Wk 2/2)

1 урок
Закрытый
10.1 Hidden Markov Models Code Challenges (Week 2)
612
81
677м 12с
1

11. Was T. rex Just a Big Chicken? (Week 1/2)

1 урок
Закрытый
11.1 Proteomics Code Challenges Week 1
888
480
295м 53с
2

12. Was T. rex Just a Big Chicken? (Week 2/2)

1 урок
Закрытый
12.1 Proteomics Code Challenges Week 2
797
300
269м 5с
-1