Курс на Stepik
Обложка курса «Medical Genomics and Bioinformatics» на Stepik
Бесплатно

Medical Genomics and Bioinformatics ★ 0.000

Открыть на
STEPIK.ORG

Module of the Master of Advanced Genetics. Practical afternoon sessions using web resources to manage and analyse genomics data.

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Medical Genomics and Bioinformatics»Учеников на курсе 309
Сертификаты, выданные на курсе «Medical Genomics and Bioinformatics»Сертификатов выдано 0
Отзывы о курсе «Medical Genomics and Bioinformatics»Отзывов получено 0
Рейтинг курса «Medical Genomics and Bioinformatics»Рейтинг курса 0.000
Уроки в курсе «Medical Genomics and Bioinformatics»Количество уроков 28
Тесты в курсе «Medical Genomics and Bioinformatics»Количество квизов 48
Время прохождения курса «Medical Genomics and Bioinformatics»Время прохождения курса —
Обновления курса «Medical Genomics and Bioinformatics»Обновления курса — —
Дата публикации курса «Medical Genomics and Bioinformatics»Дата публикации курса — ———
Последнее обновление курса «Medical Genomics and Bioinformatics»Последнее обновление — ———

Содержание курса

Разделы в курсе «Medical Genomics and Bioinformatics» 5 разделов Уроки в курсе «Medical Genomics and Bioinformatics» 28 уроков Тесты в курсе «Medical Genomics and Bioinformatics» 48 тестов Время прохождения курса «Medical Genomics and Bioinformatics» 11 ч. Последнее обновление курса «Medical Genomics and Bioinformatics» обн. 12 января 2026

1. DATABASE RESOURCES

4 урока
Закрытый
1.1 Bioinformatics data analysis - Brief Introduction ↗
285
186
2м 37с
2
Закрытый
1.2 OMIM ↗
184
79
44м 50с
1
Закрытый
1.3 ClinVar ↗
128
95
40м 6с
1
Закрытый
1.4 UCSC: A graphical viewing tool of genomic data ↗
116
88
45м 38с
2

2. COPY NUMBER DATA ANALYSIS - Galaxy tools

3 урока
Закрытый
2.1 Copy Number Variation (CNVs) ↗
114
38
11м 21с
0
Закрытый
2.2 Case analysis with Galaxy and UCSC Tables ↗
107
81
139м 0с
0
Закрытый
2.3 Workflow analysis ↗
105
46
28м 52с
0

3. ANALYSIS OF NGS DATA with Galaxy

11 уроков
Закрытый
3.1 Overview of NGS analysis ↗
107
36
6м 55с
0
Закрытый
3.2 Import data to Galaxy ↗
107
17
24м 13с
0
Закрытый
3.3 FASTQ quality control with fastqc and MultiQC ↗
110
92
19м 39с
0
Закрытый
3.4 Fastq adapter trimming with trimmomatic ↗
110
110
1м 47с
0
Закрытый
3.5 Alignment against reference genome with BWA-MEM ↗
106
95
25м 1с
0
Закрытый
3.6 Coverage / depth of alignments ↗
104
92
18м 46с
0
Закрытый
3.7 Preparing alignment for variant calling ↗
104
91
20м 3с
0
Закрытый
3.8 Variant calling/detection ↗
105
44
35м 34с
0
Закрытый
3.9 View alignments in IGV ↗
102
46
17м 34с
0
Закрытый
3.10 Saving Galaxy workflow ↗
102
102
1м 43с
0
Закрытый
3.11 NGS analysis of cases 2, 3 and 4 ↗
93
93
1м 15с
0

4. NGS VARIANT ANALYSIS AND INTERPRETATION

6 уроков
Закрытый
4.1 Overview - Variant annotation and interpretation ↗
104
97
5м 46с
1
Закрытый
4.2 Studied cases in previous session ↗
106
106
0м 21с
1
Закрытый
4.3 VCF Annotation ↗
109
91
3м 46с
0
Открытый
4.4 Annotating variant information with wANNOVAR ↗
165
93
15м 27с
0
Закрытый
4.5 Prioritisation of annotated variants ↗
105
79
53м 15с
0
Закрытый
4.6 Analysis of Cases 1, 2, 3, 4 ↗
104
43
85м 6с
0

5. WRAP UP SESSION AND CLINICAL REPORTS DEBATE/DISCUSSION

4 урока
Закрытый
5.1 Contents of the session ↗
68
68
0м 12с
0
Закрытый
5.2 Summary/Discussion of results from Session 2 (CNVs) ↗
101
84
9м 54с
0
Закрытый
5.3 Summary/Discussion of NGS results from Session 4 ↗
95
82
2м 42с
0
Закрытый
5.4 Clinical NGS report examples discussion/debate ↗
98
98
0м 22с
0