Курс на Stepik
Обложка курса «Medical Genomics and Bioinformatics» на Stepik
Бесплатно

Medical Genomics and Bioinformatics ★ 0.000

Открыть на
STEPIK.ORG

Module of the Master of Advanced Genetics. Practical afternoon sessions using web resources to manage and analyse genomics data.

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Medical Genomics and Bioinformatics»Учеников на курсе 339
Сертификаты, выданные на курсе «Medical Genomics and Bioinformatics»Сертификатов выдано 0
Отзывы о курсе «Medical Genomics and Bioinformatics»Отзывов получено 0
Рейтинг курса «Medical Genomics and Bioinformatics»Рейтинг курса 0.000
Уроки в курсе «Medical Genomics and Bioinformatics»Количество уроков 28
Тесты в курсе «Medical Genomics and Bioinformatics»Количество квизов 48
Время прохождения курса «Medical Genomics and Bioinformatics»Время прохождения курса —
Обновления курса «Medical Genomics and Bioinformatics»Обновления курса — —
Дата публикации курса «Medical Genomics and Bioinformatics»Дата публикации курса — ———
Последнее обновление курса «Medical Genomics and Bioinformatics»Последнее обновление — ———

Содержание курса

Разделы в курсе «Medical Genomics and Bioinformatics» 5 разделов Уроки в курсе «Medical Genomics and Bioinformatics» 28 уроков Тесты в курсе «Medical Genomics and Bioinformatics» 48 тестов Время прохождения курса «Medical Genomics and Bioinformatics» 11 ч. Последнее обновление курса «Medical Genomics and Bioinformatics» обн. 12 января 2026

DATABASE RESOURCES

4 урока
1. Bioinformatics data analysis - Brief Introduction ↗
2. OMIM ↗
3. ClinVar ↗
4. UCSC: A graphical viewing tool of genomic data ↗

COPY NUMBER DATA ANALYSIS - Galaxy tools

3 урока
1. Copy Number Variation (CNVs) ↗
2. Case analysis with Galaxy and UCSC Tables ↗
3. Workflow analysis ↗

ANALYSIS OF NGS DATA with Galaxy

11 уроков
1. Overview of NGS analysis ↗
2. Import data to Galaxy ↗
3. FASTQ quality control with fastqc and MultiQC ↗
4. Fastq adapter trimming with trimmomatic ↗
5. Alignment against reference genome with BWA-MEM ↗
6. Coverage / depth of alignments ↗
7. Preparing alignment for variant calling ↗
8. Variant calling/detection ↗
9. View alignments in IGV ↗
10. Saving Galaxy workflow ↗
11. NGS analysis of cases 2, 3 and 4 ↗

NGS VARIANT ANALYSIS AND INTERPRETATION

6 уроков
1. Overview - Variant annotation and interpretation ↗
2. Studied cases in previous session ↗
3. VCF Annotation ↗
4. Annotating variant information with wANNOVAR ↗
5. Prioritisation of annotated variants ↗
6. Analysis of Cases 1, 2, 3, 4 ↗

WRAP UP SESSION AND CLINICAL REPORTS DEBATE/DISCUSSION

4 урока
1. Contents of the session ↗
2. Summary/Discussion of results from Session 2 (CNVs) ↗
3. Summary/Discussion of NGS results from Session 4 ↗
4. Clinical NGS report examples discussion/debate ↗