Курс на Stepik
Обложка курса «Анализ данных NGS: практика для начинающих.» на Stepik
3 000 ₽

Анализ данных NGS: практика для начинающих. 4.500

Открыть на
STEPIK.ORG

Лабораторный практикум для начинающих: Это небольшое исследование от сырых данных до сборки генома. Мы покажем ГДЕ и КАК можно взять данные и ЧТО с ними в принципе можно сделать полезного, используя доступный любому биологу обычный компьютер.

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Учеников на курсе 123
Сертификаты, выданные на курсе «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Сертификатов выдано 23
Отзывы о курсе «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Отзывов получено 2
Рейтинг курса «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Рейтинг курса 4.500
Уроки в курсе «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Количество уроков 19
Тесты в курсе «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Количество квизов 49
Время прохождения курса «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Время прохождения курса
Стоимость курса «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Стоимость курса 3 000 ₽
Обновления курса «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Обновления курса
Дата публикации курса «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Дата публикации курса
Последнее обновление курса «Анализ данных NGS: практика для начинающих.»Последнее обновление
Сложность easy

Содержание курса

Разделы в курсе «Анализ данных NGS: практика для начинающих.» 6 разделов Уроки в курсе «Анализ данных NGS: практика для начинающих.» 19 уроков Тесты в курсе «Анализ данных NGS: практика для начинающих.» 49 тестов Время прохождения курса «Анализ данных NGS: практика для начинающих.» 14 ч. Последнее обновление курса «Анализ данных NGS: практика для начинающих.» обн. 1 год назад

1. Введение

5 уроков
Открытый
1.1 Что это за практика?
776
446
1м 46с
2
Открытый
1.2 Что нам понадобится? Системные требования.
588
199
1м 27с
2
Открытый
1.3 Настройка рабочего пространства - что именно?
489
86
9м 2с
1
Открытый
1.4 Откуда и какие данные возьмем?
423
65
58м 33с
3
Открытый
1.5 Что со всем этим можно делать?
365
365
1м 3с
2

2. Входной контроль качества

3 урока
Закрытый
2.1 Оценка качества - FastQC
101
42
50м 5с
-1
Закрытый
2.2 Пробоподготовка - Trimmomatic
94
37
476м 31с
-1
Закрытый
2.3 Проверка контаминации - таксономическая проверка
73
31
41м 47с
0

3. Выравнивание прочтений и поиск вариантов

3 урока
Закрытый
3.1 Выравнивание и визуализация
78
19
79м 25с
1
Закрытый
3.2 Поиск вариантов и визуализация
69
21
33м 53с
1
Закрытый
3.3 Аннотация вариантов
68
23
30м 32с
1

4. Сборка генома

2 урока
Закрытый
4.1 От ридов к контигам
70
11
74м 22с
0
Закрытый
4.2 От контигов к консенсусу
58
11
3м 40с
0

5. Заключение

3 урока
Закрытый
5.1 Pipeline - блок-схема.
71
71
0м 7с
3
Закрытый
5.2 Итоговый тест
58
21
6м 47с
0
Закрытый
5.3 Послесловие
53
53
0м 11с
1

6. Филогенетика - поиск родственников

3 урока
Закрытый
6.1 Выбор последовательности
31
8
2м 1с
0
Закрытый
6.2 Множественное выравнивание
23
7
1м 54с
0
Закрытый
6.3 Построение филогенетического дерева
25
4
1м 21с
0