Курс на Stepik
Обложка курса «Медицинская биоинформатика» на Stepik
Бесплатно

Медицинская биоинформатика ★ 4.667

Открыть на
STEPIK.ORG

Медицинская биоинформатика. Базовый уровень Linux, bash, основы языка Python. Понятие NGS-секвенирования и пайплайн обработки результатов секвенирования ДНК. Молекулярное моделирование и докинг. Познакомитесь с основами персонализованной прецизионной медицины, основанной на генетических признаках, а также усвоите основы современных методов фармакопоиска.

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Медицинская биоинформатика»Учеников на курсе 2 417
Сертификаты, выданные на курсе «Медицинская биоинформатика»Сертификатов выдано 0
Отзывы о курсе «Медицинская биоинформатика»Отзывов получено 6
Рейтинг курса «Медицинская биоинформатика»Рейтинг курса 4.667
Уроки в курсе «Медицинская биоинформатика»Количество уроков 85
Тесты в курсе «Медицинская биоинформатика»Количество квизов 255
Задачи с кодом в курсе «Медицинская биоинформатика»Количество задач с кодом 26
Время прохождения курса «Медицинская биоинформатика»Время прохождения курса —
Обновления курса «Медицинская биоинформатика»Обновления курса — —
Дата публикации курса «Медицинская биоинформатика»Дата публикации курса — ———
Последнее обновление курса «Медицинская биоинформатика»Последнее обновление — ———

Содержание курса

Разделы в курсе «Медицинская биоинформатика» 22 раздела Уроки в курсе «Медицинская биоинформатика» 85 уроков Тесты в курсе «Медицинская биоинформатика» 255 тестов Задачи в курсе «Медицинская биоинформатика» 26 задач Время прохождения курса «Медицинская биоинформатика» 11 ч. Последнее обновление курса «Медицинская биоинформатика» обн. 26 мая 2026

1. Введение в алгоритмизацию и основы Python

6 уроков
Закрытый
1.1 Зачем это нужно ↗
1 592
996
1м 14с
14
Закрытый
1.2 Основные достоинства языка Python ↗
992
759
5м 13с
17
Закрытый
1.3 Основы алгоритмизации ↗
830
626
6м 29с
20
Закрытый
1.4 Установка Python ↗
682
535
4м 3с
11
Закрытый
1.5 Знакомство с Python ↗
601
519
6м 6с
9
Закрытый
1.6 Работа в IDE ↗
566
483
7м 5с
16

2. Основы Python: Переменные, Типы данных, Ввод/Вывод и Отладка

8 уроков
Закрытый
2.1 Понятие переменной. Оператор присваивания ↗
559
408
12м 6с
9
Закрытый
2.2 Ввод и вывод данных ↗
453
398
4м 15с
11
Закрытый
2.3 Основные типы данных: булевский тип, числа, строки ↗
430
351
9м 17с
5
Закрытый
2.4 Cписки, множества, словари, кортежи ↗
403
350
10м 36с
10
Закрытый
2.5 Строковые методы. Escape-последовательности ↗
377
294
16м 34с
8
Закрытый
2.6 Индексация и срезы последовательностей ↗
343
278
13м 0с
7
Закрытый
2.7 Файлы. Работа с файлами, файловый ввод и вывод ↗
335
294
6м 15с
4
Закрытый
2.8 Способы отладки ↗
324
294
3м 14с
9

3. Инструкции и циклы. Функции, классы, модули

8 уроков
Закрытый
3.1 Логические выражения. Условный оператор ↗
326
247
13м 49с
9
Закрытый
3.2 Исключения. Перехват исключений с помощью try и except ↗
302
269
7м 13с
5
Закрытый
3.3 Циклы while и for ↗
302
240
11м 19с
3
Закрытый
3.4 Обход последовательностей, методы списков, множеств и словарей ↗
284
264
3м 24с
5
Закрытый
3.5 Итераторы и оператор yield ↗
285
256
8м 2с
5
Закрытый
3.6 Функция. Вызов функции ↗
274
200
12м 33с
7
Закрытый
3.7 Модули и пакеты модулей ↗
253
227
5м 38с
2
Закрытый
3.8 Классы, конструктор класса, атрибуты, наследование ↗
258
210
7м 38с
5

4. Система контроля версий. Git и GitHub

5 уроков
Закрытый
4.1 Введение в GIT ↗
307
221
4м 1с
3
Закрытый
4.2 Основные команды Git и состояния файлов ↗
253
199
3м 16с
2
Закрытый
4.3 Ветвление и работа с ветками в Git ↗
228
186
3м 20с
3
Закрытый
4.4 Основы работы с GitHub ↗
219
175
4м 38с
1
Закрытый
4.5 Совместная работа и разрешение конфликтов в Git ↗
217
184
3м 5с
4

5. Финальная работа

1 урок
Закрытый
5.1 Контрольное занятие ↗
571
319
1м 42с
2

6. Первые шаги в ОС Linux

4 урока
Закрытый
6.1 Знакомство с ОС Linux ↗
366
267
6м 34с
6
Закрытый
6.2 Основные понятия Linux ↗
294
247
6м 29с
7
Закрытый
6.3 Установка: dual-boot, виртуальная машина ↗
299
238
3м 26с
3
Закрытый
6.4 Установка: WSL ↗
296
207
6м 19с
4

7. Работа в командной строке

4 урока
Закрытый
7.1 Терминал. Первые команды на Bash ↗
295
170
9м 5с
-2
Закрытый
7.2 Менеджеры пакетов apt и pip ↗
246
116
9м 49с
4
Закрытый
7.3 Терминальный мультиплексор tmux ↗
237
174
4м 38с
3
Закрытый
7.4 Работа в VS Code: аспекты WSL ↗
238
181
6м 8с
1

8. Файловая система и пользователь

3 урока
Закрытый
8.1 Файловая система Linux ↗
239
204
2м 22с
0
Закрытый
8.2 Доступ к файлам. Права пользователей ↗
220
194
2м 29с
1
Закрытый
8.3 Файлы инициализации оболочки ↗
217
118
6м 9с
-6

9. Основные операции

6 уроков
Закрытый
9.1 Основные команды в Linux ↗
226
128
9м 29с
-11
Закрытый
9.2 Работа с файлами ↗
206
111
15м 25с
-5
Закрытый
9.3 Файловые потоки и поиск ↗
191
118
7м 29с
1
Закрытый
9.4 Поиск файлов ↗
191
112
9м 44с
-2
Закрытый
9.5 История ↗
185
166
2м 33с
0
Закрытый
9.6 Документация Linux ↗
178
159
2м 49с
2

10. Процессы

3 урока
Закрытый
10.1 Процессы ↗
210
116
3м 19с
1
Закрытый
10.2 Метрики ↗
203
120
8м 52с
1
Закрытый
10.3 Контроль и планирование ↗
183
93
5м 29с
1

11. Работа с файлами

6 уроков
Закрытый
11.1 Ещё немного о файловой системе ↗
187
161
2м 56с
2
Закрытый
11.2 diff, file и компрессия ↗
178
116
4м 4с
1
Закрытый
11.3 Текстовые редакторы ↗
170
139
3м 37с
5
Закрытый
11.4 Чтение текста: cat и echo ↗
166
114
4м 21с
1
Закрытый
11.5 Обработка текста ↗
166
76
12м 47с
3
Закрытый
11.6 Анализ текста ↗
160
67
10м 10с
-2

12. Работа в сети

1 урок
Закрытый
12.1 Сеть ↗
188
169
1м 36с
0

13. Безопасность

2 урока
Закрытый
13.1 Общие понятия о безопасности в Linux ↗
182
111
2м 30с
1
Закрытый
13.2 Права суперпользователя: когда они нужны? ↗
159
147
1м 38с
1

14. Скрипты в Linux

3 урока
Закрытый
14.1 Возможности скриптов. Синтаксис и конструкции ↗
189
109
7м 16с
1
Закрытый
14.2 Основной синтаксис bash-скриптов ↗
165
131
1м 9с
1
Закрытый
14.3 Конструкции ↗
160
86
3м 39с
0

15. Linux для биоинформатики

2 урока
Закрытый
15.1 Понятие окружения (environment) и виртуализация ↗
221
151
2м 34с
0
Закрытый
15.2 Менеджер пакетов conda ↗
201
136
6м 24с
-1

16. Финальный проект

1 урок
Закрытый
16.1 Финальный проект ↗
271
43
47м 35с
-2

17. Базы данных. Понятие референсного генома

3 урока
Закрытый
17.1 Базы данных в биоинформатике ↗
306
99
15м 58с
5
Закрытый
17.2 Запросы (search filters) и система EDirect ↗
226
70
9м 1с
1
Закрытый
17.3 Референсные геномы ↗
216
66
15м 39с
4

18. Технология секвенирования. Fastq-файл

3 урока
Закрытый
18.1 Технология секвенирования ↗
247
96
9м 41с
3
Закрытый
18.2 Формат FASTQ ↗
221
59
18м 53с
3
Закрытый
18.3 Контроль качества ↗
178
55
4м 33с
0

19. Высокопроизводительное секвенирование ДНК

3 урока
Закрытый
19.1 Выравнивание ридов ↗
205
59
9м 8с
1
Закрытый
19.2 Поиск генетических вариантов ↗
168
32
22м 17с
0
Закрытый
19.3 Интерпретация результатов ↗
157
25
7м 3с
3

20. Метагеномика

3 урока
Закрытый
20.1 Секвенирование гена 16S рРНК ↗
188
107
2м 32с
0
Закрытый
20.2 QIIME 2 -- основы обработки данных ↗
162
97
3м 35с
-1
Закрытый
20.3 QIIME 2 -- анализ результатов ↗
127
21
10м 41с
0

21. Молекулярное моделирование

6 уроков
Закрытый
21.1 Основы структурной биоинформатики ↗
250
19
54м 36с
0
Закрытый
21.2 3D-структуры белков ↗
213
27
26м 47с
1
Закрытый
21.3 Визуализация и структурный анализ белков ↗
175
14
35м 52с
0
Закрытый
21.4 Молекулярная динамика ↗
177
93
2м 13с
2
Закрытый
21.5 Молекулярная динамика - практика в Gromacs ↗
166
112
2м 13с
1
Закрытый
21.6 Computer Aided Drug Design (CADD) ↗
170
87
2м 37с
1

22. Финальный проект

4 урока
Закрытый
22.1 Пояснение ↗
215
215
0м 15с
0
Закрытый
22.2 Финальный проект по молекулярному моделированию ↗
255
255
2м 19с
1
Закрытый
22.3 Финальный проект по секвенированию ДНК ↗
217
217
2м 33с
1
Закрытый
22.4 Финальный проект по метагеномике ↗
211
211
2м 41с
1