Курс на Stepik
Обложка курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» на Stepik
Бесплатно

Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore 4.868

Открыть на
STEPIK.ORG

Основы секвенирования 3-го поколения на платформе Oxford Nanopore. Рассматриваются основные применения, типы предлагаемых приборов, используемые протоколы, и особенности биоинформатической обработки получаемых данных.

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Учеников на курсе 5 280
Сертификаты, выданные на курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Сертификатов выдано 776
Отзывы о курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Отзывов получено 76
Рейтинг курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Рейтинг курса 4.868
Уроки в курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Количество уроков 25
Тесты в курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Количество квизов 24
Время прохождения курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Время прохождения курса
Обновления курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Обновления курса
Дата публикации курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Дата публикации курса
Последнее обновление курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Последнее обновление

Содержание курса

Разделы в курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» 4 раздела Уроки в курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» 25 уроков Тесты в курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» 24 теста Время прохождения курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» 4 ч. Последнее обновление курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» обн. 2 года назад

Знакомство с технологией Oxford Nanopore

6 уроков
1. Введение
2. Сравнение возможностей секвенирования 2-го и 3-го поколения
3. Преимущества и проблемы нанопорного секвенирования
4. Краткая история Oxford Nanopore
5. Разнообразие приборов от Oxford Nanopore
6. Дополнительная информация и ссылки к первому модулю

Протоколы, используемые Oxford Nanopore

6 уроков
1. Основные протоколы секвенирования ДНК: rapid, 1D и 1D^2
2. Баркодирование библиотек
3. Прямое секвенирование РНК: первый взгляд на РНК без посредников
4. Выделение длинной ДНК
5. Проверка ячеек, подготовка к секвенированию и секвенирование
6. Ссылки ко второму модулю

Применения нанопорного секвенирования

5 уроков
1. Полногеномное секвенирование: соединяй и властвуй
2. Секвенирование ампликонов: 16S, 18S, и другие
3. Секвенирование кДНК и прямое секвенирование РНК
4. Анализ сложных структурных вариантов ДНК
5. Ссылки к третьему модулю

Биоинформатика длинных прочтений

8 уроков
1. Определение последовательности из сигнала (Basecalling)
2. Выравнивание длинных прочтений
3. Гибридная и прямая сборка длинных прочтений
4. Полировка геномных сборок
5. Анализ данных метагеномного секвенирования
6. Обработка результатов секвенирования кДНК и РНК
7. Ссылки к четвертому модулю
8. Заключение