Курс на Stepik
Обложка курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» на Stepik
Бесплатно

Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore ★ 4.868

Открыть на
STEPIK.ORG

Основы секвенирования 3-го поколения на платформе Oxford Nanopore. Рассматриваются основные применения, типы предлагаемых приборов, используемые протоколы, и особенности биоинформатической обработки получаемых данных.

Показатель Текущие показатели Рост
Значение 🏆 Рейтинг 3 дн 7 дн 30 дн
Количество учеников на курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Учеников на курсе 5 212
Сертификаты, выданные на курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Сертификатов выдано 759
Отзывы о курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Отзывов получено 76
Рейтинг курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Рейтинг курса 4.868
Уроки в курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Количество уроков 25
Тесты в курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Количество квизов 24
Время прохождения курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Время прохождения курса —
Обновления курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Обновления курса — —
Дата публикации курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Дата публикации курса — ———
Последнее обновление курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore»Последнее обновление — ———

Содержание курса

Разделы в курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» 4 раздела Уроки в курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» 25 уроков Тесты в курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» 24 теста Время прохождения курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» 4 ч. Последнее обновление курса «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» обн. 2 года назад

1. Знакомство с технологией Oxford Nanopore

6 уроков
Открытый
1.1 Введение ↗
4 700
2 169
3м 37с
38
Открытый
1.2 Сравнение возможностей секвенирования 2-го и 3-го поколения ↗
2 356
1 398
15м 2с
44
Открытый
1.3 Преимущества и проблемы нанопорного секвенирования ↗
1 837
1 249
12м 17с
25
Открытый
1.4 Краткая история Oxford Nanopore ↗
1 582
1 149
11м 37с
22
Открытый
1.5 Разнообразие приборов от Oxford Nanopore ↗
1 484
1 105
12м 20с
23
Открытый
1.6 Дополнительная информация и ссылки к первому модулю ↗
1 418
1 225
1м 5с
19

2. Протоколы, используемые Oxford Nanopore

6 уроков
Открытый
2.1 Основные протоколы секвенирования ДНК: rapid, 1D и 1D^2 ↗
1 514
1 002
15м 5с
33
Открытый
2.2 Баркодирование библиотек ↗
1 290
968
6м 45с
21
Открытый
2.3 Прямое секвенирование РНК: первый взгляд на РНК без посредников ↗
1 201
895
5м 27с
8
Открытый
2.4 Выделение длинной ДНК ↗
1 180
828
13м 14с
24
Открытый
2.5 Проверка ячеек, подготовка к секвенированию и секвенирование ↗
1 137
863
25м 25с
25
Открытый
2.6 Ссылки ко второму модулю ↗
1 040
910
1м 55с
11

3. Применения нанопорного секвенирования

5 уроков
Открытый
3.1 Полногеномное секвенирование: соединяй и властвуй ↗
1 148
796
23м 42с
26
Открытый
3.2 Секвенирование ампликонов: 16S, 18S, и другие ↗
1 036
794
12м 32с
21
Открытый
3.3 Секвенирование кДНК и прямое секвенирование РНК ↗
1 002
766
13м 9с
19
Открытый
3.4 Анализ сложных структурных вариантов ДНК ↗
987
795
7м 52с
17
Открытый
3.5 Ссылки к третьему модулю ↗
919
780
2м 30с
10

4. Биоинформатика длинных прочтений

8 уроков
Открытый
4.1 Определение последовательности из сигнала (Basecalling) ↗
1 174
757
15м 1с
21
Открытый
4.2 Выравнивание длинных прочтений ↗
1 064
779
8м 42с
14
Открытый
4.3 Гибридная и прямая сборка длинных прочтений ↗
1 031
734
17м 41с
19
Открытый
4.4 Полировка геномных сборок ↗
967
694
9м 10с
12
Открытый
4.5 Анализ данных метагеномного секвенирования ↗
988
681
7м 38с
14
Открытый
4.6 Обработка результатов секвенирования кДНК и РНК ↗
983
715
4м 11с
12
Открытый
4.7 Ссылки к четвертому модулю ↗
945
738
1м 34с
13
Открытый
4.8 Заключение ↗
868
726
1м 38с
16